1．根据土壤中微量元素的丰缺状况，采用缺什么补什么，不可盲目施用和过量施用。作物需要中微量元素的数量很少，许多微量元素从缺乏到适量的浓度范围很窄，因此，施用中微量元素肥料要严格控制用量，防止浓度过大，施用必须注意均匀。也可将中微量元素肥料拌混到有机肥料中施用。

2．根据土壤的酸碱度施用。土壤pH过高时，会降低土壤中钙、镁、硫、硼、锌、锰、钼等元素的有效性；而在酸性土壤常会引起作物缺钼。所以应根据土壤的酸碱度，有针对性地施用中微肥。

3．根据作物对中微量元素的反应选择施用。各种作物对不同的中微量元素有不同的反应，敏感程度不同，需要量也不同，施用效果有明显差异，如玉米施锌肥效果较好，油菜对硼敏感，禾本科作物对锰敏感，豆科作物对钼、硼敏感。所以，要针对不同作物对不同中微量元素的敏感程度和肥效，合理选择和施用。

4．根据天气状况补充相应的中微量元素。温度和雨量会影响土壤中微量元素的释放和作物对它们的吸收。如早春遇低温时，早稻容易缺锌；冬季干旱，会影响根系对硼的吸收；降雨量较多的地区，尤其质地较粗的土壤，容易引起土壤铁、硼、钼等的淋洗，会促进作物产生缺铁、缺硼、缺钼症。因此，要根据天气状况补充相应的中微量元素。

5．注意与大量中元素肥料、有机肥料配合施用。只有在满足了作物对大量元素氮、磷、钾等需要的前提下，中微量元素肥料才能表现出明显的增产效果。有机肥料含有多种微量元素，作为维持土壤微量元素肥力的一个重要养分补给源，不可忽视。施用有机肥料，可调节土壤环境条件，达到提高中微量元素有效性的目的。